Το Μουσείο αποδόθηκε στο κοινό το 2022. Το κέλυφός του ολοκληρώθηκε το 2016 με πιστώσεις από το Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Ανταγωνιστικότητα και Επιχειρηματικότητα 2007-2013» (ΕΣΠΑ), ενώ η μόνιμη έκθεση με πόρους του Ε.Π. «Ανταγωνιστικότητα, Επιχειρηματικότητα, Καινοτομία 2014-2020» (ΕΣΠΑ).
Στη μόνιμη έκθεση του Μουσείου επιχειρείται ένα οδοιπορικό στους αρχαιολογικούς χώρους και τα μνημεία της Π.Ε. Έβρου από την 6η χιλιετία π.Χ. έως τον 4ο αι. μ.Χ. Παρουσιάζονται περισσότερα από 1.400 ευρήματα προϊστορικών έως και ρωμαϊκών χρόνων, προερχόμενα από συστηματικές ανασκαφές και επιφανειακές έρευνες στο χερσαίο τμήμα της Περιφερειακής Ενότητας Έβρου. Το πλούσιο εκθεσιακό υλικό έχει κατανεμηθεί σε 2 ενότητες, που αντιστοιχούν στη γεωμορφολογία της περιοχής (παραλιακό μέτωπο προς το Αιγαίο, εύφορη ενδοχώρα μεταξύ των ποταμών Έβρου και Άρδα), ενώ σε μία 3η ενότητα γίνεται ειδική αναφορά στην ανάπτυξη των ταφικών τύμβων, κυρίαρχο στοιχείο του θρακικού τοπίου (145 σε όλη την Περιφερειακή Ενότητα). Πρόκειται για μια εξαιρετικά ευχάριστη έκθεση, χάρη στον άπλετο φυσικό φωτισμό, την ευρυχωρία, τον ευφυή γραφιστικό χειρισμό και τις σύγχρονες σκηνογραφικές παρεμβάσεις. Επιπλέον, συμβατικά ερμηνευτικά μέσα, όπως σύντομα ενημερωτικά κείμενα, χάρτες, φωτογραφίες και σχέδια, αλλά και βιντεοπροβολές ή πολυμεσικές εφαρμογές εμπλουτίζουν τη μουσειακή εμπειρία.
Το Μουσείο διαθέτει χώρο περιοδικών εκθέσεων, ευρύχωρες και καλά οργανωμένες αποθήκες για τη φύλαξη του ανασκαφικού υλικού στο υπόγειο, δύο σύγχρονα εργαστήρια συντήρησης, πωλητήριο, εν λειτουργία αναψυκτήριο, καθώς και χώρο στάθμευσης οχημάτων για τους επισκέπτες.
Στο πλαίσιο της πιστοποίησης, οργανώθηκε αρτιότερα ο χώρος μελέτης αρχαιολογικών ευρημάτων εντός των αποθηκών, αναβαθμίστηκε η δίγλωσση ιστοσελίδα του Μουσείου με προδιαγραφές ψηφιακής προσβασιμότητας και παράχθηκε ενημερωτικό υλικό σε γραφή braille για τους μη βλέποντες.
Το Μουσείο πιστοποιήθηκε τον Απρίλιο 2026.